mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATAACATACACACACACGTAT AGTTGTGTGTGCATGTTCATGTCT TGTATGTGCATGTGTGTATAGTTGTGTGTGCATGTTCATGTCTATATTTGAATATACATAACATACACACACACGTATAAACGCAAGCACACATACA 3 1 3' arm Mus_musculus mirbase 100 mmu-mir-669a-1 3e-50 -36.8 .((((((((.(((((.((((..((((((((.(((((.((((.(((......))).))))))))).))))))))..)))).))))).)))))..))). (-36.80)