mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGACACATGGTCTACTTCT ATGCGGTTGACCATGGTGTGTACG GTGAGCTGGAATCAGCCAGCGTTACCTCAAGGTATTTGAAGATGCGGTTGACCATGGTGTGTACGCTTTATTTATGACGTAGGACACATGGTCTACTTCTTCTCAATATCACATCTCGCC 5 3 3' arm Mus_musculus mirbase mir-154 1e-31 eca-mir-1197 2e-42 -37.2 (((((((((......)))))..........((((((.(((((...(((.(((((((...(.(((((.........).)))).)...))))))).))))))))..)))))).....)))). (-37.20)