mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAGGACTGGGGAGGTGGAG CTCCCCCCACCTCTTCTCTCCTCAG GTGAGGACTGGGGAGGTGGAGGGTAGCATCATTAGAGCCAGAGCTCTGTCTCAGCTCCCTCTCCCCCCACCTCTTCTCTCCTCAG 3 6 5' arm Mus_musculus mirbase mir-1224 7e-42 rno-mir-1224 2e-38 -43.2 .((((((..((((((((((((((.(((.....((((((....)))))).....)))))))......))))))))))..)))))). (-43.20)