mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCAGTTCCCAACCCGTCGG TCTGAGGGCTGGGCTCGGGGGTCCCAGTTCCCAACCCGTCGGCTGTCAGCGGACTGCTCGAGCTGCTTCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCTCTCTCGGGAGCTTT GTCTCTGGTCGATGGATCAATGTAGGCAAGGGAAGTCGGCAAAATGGATCCGTAACTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCTCGGGGGTCCCAGTTCCCAACCCGTCGGCTGTCAGCGGACTGCTCGAGCTGCTTCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCTCTCTCGGGAGCTTTCCCCGGGCGTCGAACTATTCAGCTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTGGGGTGCACACAAAGCATTGCGATGGTCCCTGCGGATGCTAACACAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTCCGACTTTGTGAAATGACTTGAGAGGTGTANNGATAGTGGGAGCTTCGGCGCAAGTGAAATACCACTACTTTTAACGTTATTTTACTTACTCCGTGAATC 5 1 3' arm Arabidopsis_thaliana mirnest 100 peu-MIR2911 9e-30 -68.1 ((((((.......))))))..(((((((((....(((((((((.....((((.((((((..(((((....)))))..))))))....))))..))))).))))....)))))))))..((((((....)))))).. (-68.1)