mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTAGTGGAGACTGGTGTGGCTA GAAACCACCTCTCTTCACTTACTT TGGGTGGGGGTTTAGAAACCACCTCTCTTCACTTACTTCTGAAAGTTAAAAGGTAGTGGAGACTGGTGTGGCTAAACCTCTTGCCTCCC 3 4 3' arm Mus_musculus mirbase 100 100 -37.3 .(((..(((((((((...(((((..((((((((.((((.(........).))))))))))))..)))).).))))))).))..)))... (-37.30)