mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCACCTGGAGCATGTTTTCT AAAGCATGCTCCAGTGGC CCTTTACAGAGAAAGCATGCTCCAGTGGCGCAATCGGTTAGCGCGCGGTACTTATACAGCAGTATATGTGCGGGTGATGCCGAGGTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGCATGTTTTCTTCCCTTTCCGCC 1 3 3' arm Mus_musculus mirbase tRNA 9e-21 100 -52.5 ........(((((((((((((((((.((((((((((((...(((.(.((((.(((((....))))).)))).))))..)))))..))))........)))....)))))))))))))))))........... (-52.50)