mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTACCTTTGATAGTCCACTGCC CAGTGGGCCGTGAAAGGTAGCC GTGTACTGTGGGGCAGTGGGCCGTGAAAGGTAGCCTGGTGGTCCCCTTTGAGCTAAGGCTACCTTTGATAGTCCACTGCCCCACGGTGCAT 3 0 3' arm Mus_musculus mirbase 100 mmu-mir-3061 1e-46 -65.7 (((((((((((((((((((((..(.(((((((((((...(.((......)).)..))))))))))).)..))))))))))))))))))))) (-65.70)