mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGGCCTGACCAGTCTCAAGAC CATGGGTCTGGTTGGGCCCGCA TGCTTGCGGGCCATGGGTCTGGTTGGGCCCGCAGACTCGGAGTGCGGGCCTGACCAGTCTCAAGACCTGCGTGGTA 5 0 3' arm Mus_musculus mirbase 100 mmu-mir-3091 8e-38 -46.5 ((((((((((.(.((((.(((((..((((((((.........))))))))..))))).)))).).)))))).)))) (-46.50)