mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT CTATACAATCTACTGTCTTTCC TTCACTGTGGGATGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTTAGGGTCACACCCACCACTGGGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCTAAGGTGAT 3 0 5' arm Rattus_norvegicus mirbase let-7 7e-36 mmu-let-7a-1 2e-48 -43.5 .(((((.(((((.(((..((((((((((((((((...(((.....))).((....))....))))))))))))))))..)))))))).))))). (-43.50)