mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT CTGTACAGCCTCCTAGCTTTCC CGGCATGCTCCCAGGCTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTAGAGTTACAACAAGGGAGATAACTGTACAGCCTCCTAGCTTTCCTTGGGACTTGCAC 3 0 5' arm Rattus_norvegicus mirbase let-7 3e-29 rno-mir-3596a 1e-49 -39.2 ..(((.(.(((((((..(((.(((.(((((((((((((.....................))))))))))))).))).)))..)))))))).))).. (-39.20)