mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTGTGTAT ACATACTTCTTTATGTACCCATA TGCCTACTCAGAGCACATACTTCTTTATGTACCCATATGAACATAGAATGCTATGGAATGTAAAGAAGTGTGTATTTTGGGTAGGTA 2 1 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-1 2e-26 rno-mir-3571 3e-44 -38.64 (((((((((((((.((((((((((((((((..(((((..............))))).)))))))))))))))).))))))))))))) (-38.64)