mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AACAAGTCCCAGTCTGCCACA GGACAGACCAGCCCTGTCTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTGTGTCTGTGTCCAACAACAAGTCCCAGTCTGCCACATGGTGTTGGTCACATCA 2 2 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-7 1e-25 mmu-mir-7a-2 6e-27 -36.6 .....(((((((.((((.(((.(((((.(.(((((.(((((((.(.......)))))))))))))).))))).))).)))).)))))))...... (-36.60)