mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTTGTGATTTTGTTGT AACAAGTCACAGCCAGCCTCA AGGCCAGAACACATGAGCCAATGCTATGTGGAAGACTTGTGATTTTGTTGTTCTGATATGATATGACAACAAGTCACAGCCAGCCTCATAGAGTGGACTCCCATCACCTT 5 2 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-7 1e-37 mmu-mir-7b 5e-43 -30.2 ..............((((((...(((((.((.....(((((((((.((((((.((......)).)))))))))))))))....)).)))))..))).))).......... (-30.20)