mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGT GGAGGCCCGTTTCTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGCCACAGAGCCGTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAGAAATGACTCTAA 1 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-9 4e-28 rno-mir-3597-3 4e-46 -40.1 ((((...(((((((((.(((((((((((((((.(((((..((......))..))))).))))))))))))))))).))))))).)))).. (-40.10)