mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGCAAATCCATGCAAAACTGA AGTTTTGCAGGTTTGCATCCAGC CACTGGTCTATGGTTAGTTTTGCAGGTTTGCATCCAGCTGTATAATATTCTGCTGTGCAAATCCATGCAAAACTGACTGTGGTGGTG 0 4 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-19 2e-29 mmu-mir-19b-1 3e-44 -38.02 ((((...(((((((((((((((((((((((((..((((.............)))))))))).)).))))))))))))))))).)))) (-38.02)