mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAGTGCTCATAGTGCAGGTAG ACTGCAGTGTGAGCACTTCTGGT GTAGTGCCAAAGTGCTCATAGTGCAGGTAGGTTTTGCTGCACTCTACTGCAGTGTGAGCACTTCTGGTACTC 1 2 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-17 3e-34 rno-mir-20b 2e-35 -37.9 ..((((((((((((((((((.(((((.(((((........)).)))))))).))))))))))).))))))). (-37.90)