mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCTTATCAGACTGATGTTGA AACAGCAGTCGATGGGCTGTC TGTACCACCTTGTCGGGTAGCTTATCAGACTGATGTTGACTGTTGAATCTCATGGCAACAGCAGTCGATGGGCTGTCTGACATTTTGGTATC 3 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-21 4e-22 cgr-mir-21 3e-47 -43.6 .((((((...((((((..((((((((.(((((.(((((.((((.(.....)))))))))).)))))))))))))..))))))...)))))). (-43.60)