mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATTGCACTTGTCTCGGTCTGA AGGCGGAGACACGGGCAATTGCT GGCCAGTGTTGAGAGGCGGAGACACGGGCAATTGCTGGACGCTGCCCTGGGCATTGCACTTGTCTCGGTCTGACAGTGCCGGCC 5 1 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-25 4e-34 eca-mir-25 9e-38 -38.4 ((((.(..(((..((((.((((((.(.(((((.(((((.......))..)))))))).).)))))).))))..)))..).)))) (-38.40)