mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCCGC AGGGCTTAGCTGCTTGTGAGCA TGGCCTGTGGAGCAGGGCTTAGCTGCTTGTGAGCAAGGTCTACAGCAAAGTCGTGTTCACAGTGGCTAAGTTCCGCCCCCTGGACCC 3 1 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-27 1e-24 mmu-mir-27a 2e-39 -38.9 .((((.(.((.((.(((((((((..((.(((((((.((.((.......)))).)))))))))..))))))))).)).))).)).)). (-38.90)