mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGAGCTCACAGTCTATTGAG CCCACTAGATTGTGAGCTCCTGGA GGTCCCTACCCGCAAGGAGCTCACAGTCTATTGAGTTCCTTTTCTGATTCTCCCACTAGATTGTGAGCTCCTGGAGGGCAGGCACT 3 2 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-708 2e-39 mmu-mir-28 9e-32 -41.2 (((.(((.(((...((((((((((((((((..(((.((.......))..)))....))))))))))))))))...))).))).))) (-41.20)