mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGTGTT GCTGGTTTCATATGGTGGTTTAGA CTTCAGGAAGCTGGTTTCATATGGTGGTTTAGATTTAAATAGTGATTGTCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTCTTGGTGG 1 3 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-29 2e-26 eca-mir-29b 6e-39 -30.42 ..(((((((((((((((((.((((((..((((((.............)))))))))))).)))))))))).)))))))... (-30.42)