mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAGTGTAGTTAGCTGATTGC AATCACTAACCACACAGCCAGG AGTCTAGTTACTAGGCAGTGTAGTTAGCTGATTGCTAATAGTACCAATCACTAACCACACAGCCAGGTAAAAAGACT 4 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-34 3e-31 mmu-mir-34c 2e-38 -31.6 (((((..(((((.(((.((((.(((((.((((((.((....)).))))))))))).)))).))).)))))..))))) (-31.60)