mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAGTGCTGTTCGTGCAGGTAG ACTGCTGAGCTAGCACTTCCCG AGTCATGGGGGCTCCAAAGTGCTGTTCGTGCAGGTAGTGCATTGCCTGACCTACTGCTGAGCTAGCACTTCCCGAGCCCCCAGGACA 2 3 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-17 0.000005 mmu-mir-93 2e-35 -48.2 .(((.(((((((((..((((((((((((.((((.(((..((.....))..)))))))))))).)))))))...))))))))).))). (-48.20)