mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGCACTAGCACATTTTTGCT CAATCATGTGCAGTGCCAATAT CCAGTACCATCTGCTTGGCCGATTTTGGCACTAGCACATTTTTGCTTGTGTCTCTCCGCTCTGAGCAATCATGTGCAGTGCCAATATGGGAAAAGCGGGCTGCTGC 3 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-96 1e-37 mmu-mir-96 9e-51 -49.1 .(((((...(((((((..((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))..))))))).))))). (-49.10)