mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAGTGCTCAGATGTCTGTGGT CACGGATGTTTGAGCATGTGCT TAGTCAAGTGCTCAGATGTCTGTGGTGGCTGCTTATGTATCACGGATGTTTGAGCATGTGCTATGGTATCTAC 1 0 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-105 3e-34 mml-mir-105-2 2e-17 -30.3 (((.((.((((((((((((((((((((.(.......))))))))))))))))))))).))))).......... (-30.30)