mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGTGTGACAATGGTGTTTG AACGCCATCATCACACTAAACA CCTTAGCAGAGCTCTGGAGTGTGACAATGGTGTTTGTGTCCAAAACATCAAACGCCATCATCACACTAAACAGCTACTGCTAGGC 4 0 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-122 3e-35 rno-mir-3591 4e-43 -43 .((((((((((((.(..(((((((..(((((((((((((.....))).))))))))))..)))))))..).)))).)))))))). (-43.00)