mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCC TGTTCACAGCGGACCTTGAT ATCAAGATCAGAGACTCTGCTCTCCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGCGGAGCCTACGGCTGCACTTGAA 4 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-124 2e-36 mmu-mir-124-2 3e-57 -45.7 .(((((..(((((.(((((((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..))))))))).))....)))..))))). (-45.70)