mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGACCTATGAATTGACAGCC CTGCCAGTTCCATAGGTCACAG GTCAAGATGGAGTGCACAGGGCTCTGACCTATGAATTGACAGCCAGTACTCTGATCTCGCCTCTGGCTGCCAGTTCCATAGGTCACAGGTATGTTCGCCTCAATGCCAGC 2 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-192 4e-41 mml-mir-192 1e-40 -40.5 .......((..(((.(((.(.((.((((((((((((((.(((((((.....((....))...))))))).))))).))))))))).)).).))).)))..))........ (-40.50)