mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTCT AGTTGCGTCTGGACGTCCCG CTGTCCCGGGCCGCGGCTCCTGATTGTCCAAACGCAATTCTCGAGTCTCTGGCTCCGGCCGAGAGTTGCGTCTGGACGTCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCTCGAGGGGG 2 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-219 8e-27 rno-mir-219-1 6e-58 -60 .......((((.(((((((..(((.(((((.((((((((((((.(((.........))))))))))))))).))))))))..))))))).)))).....(((....))). (-60.00)