mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCAGCTCCTATATGATGCCTTT CGGCGTCATGCAGGAGTTGATTG AGTGTAGTGAGAAGTTGGGGGGTGGGAACGGCGTCATGCAGGAGTTGATTGCACAGCCATTCAGCTCCTATATGATGCCTTTCTTCACCCCCTTCAA 3 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-337 6e-49 mmu-mir-337 1e-49 -49.6 .............(..((((((((((((.(((((((((.(((((((((.((......)).))))))))).))))))))).))).))))))))).).. (-49.60)