mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAGCATCAGTGATTTTGTTGA AACAATATCCTGGTGCTGAGT TCCCCAACAATATCCTGGTGCTGAGTGGGTGCACAGTGACTCCAGCATCAGTGATTTTGTTGAAGA 2 2 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-338 1e-30 mmu-mir-338 6e-32 -27.2 ....((((((.(((((((((((((((.(.(....).).))).))))))))).))).)))))).... (-27.20)