mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCGCCTCGACGACAGAGCCA TCCCTGTCCTCCAGGAGCTCACG ACGGGGTGGACACCGTCCCTGTCCTCCAGGAGCTCACGTATGCCTGCCTGTGAGCGCCTCGACGACAGAGCCAGAGTCCACCCCTGCACTGCCCAA 6 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-339 5e-31 rno-mir-339 1e-49 -44.2 ..(((((((((.(.(.(.(((((.((.(((.(((((((((....)))..)))))).))).)).))))).).).).)))))))))............ (-44.20)