mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTCAGGCTGCTGGTTATATTC TATAACCAAAGCCCGACTGT TGATCAGTCAGGCTGCTGGTTATATTCCAGGACTTCTCTGGTCCTGGGTATAACCAAAGCCCGACTGTTAA 3 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-344 1e-33 rno-mir-344b-2 7e-35 -40.1 (((.(((((.((((..(((((((((.((((((((.....))))))))))))))))).)))).)))))))). (-40.10)