mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCTGAACTAGGGGTCTGGAGA TGCTGACCCCTAGTCCAGTGCT ACCCAAGTCCAGGCCTGCTGACCCCTAGTCCAGTGCTTGTGGTGGCTACTGGGCCCTGAACTAGGGGTCTGGAGACCTGGGTTTGATCTCCACAGG 5 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-345 2e-48 mmu-mir-345 1e-49 -47.6 ...(((..(((((.((.(.((((((((((.(((.((((((((...)))).)))).))).)))))))))).).)).)))))..)))........... (-47.60)