mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCCCTCTGGGTCGCCCA GTGGGCGCGGGGCGGGGGT GAGCCCCTGCTGGTGGGCGCGGGGCGGGGGTTTCAGGTGGTCTCGCGGTGGCCGCCCGACTGTCCCTCTGGGTCGCCCAGCTGGGGAGTTCC 5 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase 100 100 -49.5 (((((((((((((..(((.(((((.((.((((...(((((((.......))))))).)))).)).))))).)))..))))).)))).)))). (-49.50)