mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATATAATACAACCTGCTAAGTG CTTAGCACGTTGTATTATTATT CTCGGATGGATATAATACAACCTGCTAAGTGTTCTAGCACTTAGCACGTTGTATTATTATTGTCCGAG 3 0 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-374 1e-24 mmu-mir-374 6e-26 -37.9 ((((((..(..((((((((((.((((((((((....)))))))))).))))))))))..)..)))))) (-37.90)