mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACATAGAGGAAATTTCACGT GTGGATATTCCTTCTATGTTTA TTGGTATTTAAAAGGTGGATATTCCTTCTATGTTTATGGTATTTATGATTAAACATAGAGGAAATTTCACGTTTTCAGTGTCAA 3 1 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-154 1e-27 mmu-mir-376c 2e-35 -26.72 .((..(((.((((.(((((..(((((.(((((((((.............))))))))))))))..))))).)))).)))..)). (-26.72)