mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAATCACACAAAGGCAACTTTT AGGTTGCCCTTGGTGAATTCGCT CTTGAGCAGAGGTTGCCCTTGGTGAATTCGCTTTATTGATGTTGAATCACACAAAGGCAACTTTTGGTTGAG 1 2 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-154 3e-28 mmu-mir-377 1e-30 -29 ((..(.(((((((((((.(((((((.(((((.........).)))))))).))).))))))))))).)..)) (-29.00)