mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC TGGTTCCTGCAGAGGTGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTCTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCA 3 0 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-154 2e-30 bta-mir-379 2e-29 -33.6 .((...(((.((((.((((.(((((((..(((((((((.........)).)))))))..))))))).)))).)))))))...)). (-33.60)