mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTTACCCGAGCAACTTTGCAT GACGAATGTTGCTCGGTGAACCCCT GGTACTCGGAGAGAGGTTACCCGAGCAACTTTGCATCTGGAGGACGAATGTTGCTCGGTGAACCCCTTTTCGGTATC 5 2 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-154 5e-30 mmu-mir-409 2e-38 -36.4 (((((.(((((((.((((..((((((((((((((........).)))).)))))))))..)))).)))))))))))) (-36.40)