mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTCACCTGGTCCACTAGCCGT GGATGGTCGACCAGCTGGAAAGTA GGGACGGATGGTCGACCAGCTGGAAAGTAATTGTTTCTAATGTACTTCACCTGGTCCACTAGCCGTCGGT 3 2 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-412 2e-26 mmu-mir-412 3e-34 -26.3 ..(((((.((((.((((((.(((..((((((((....)))).))))))).)))))).)))).)))))... (-26.30)