mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCTCATTAAATGTTTGTTG ACAGACATTAATTGGGCGCCTG CACACTGTAGGCCTCATTAAATGTTTGTTGAATGAAAAAATGAATCATCAACAGACATTAATTGGGCGCCTGCTCTGTG 3 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase 100 eca-mir-421 3e-37 -33.9 ((((..((((((((((...((((((((((((.(((.........)))))))))))))))...)))).))))))..)))) (-33.90)