mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTATTACATGGCCAATCTCC AGGTTGTCCATGGTGTGTTCA AGTGTTCGAATGGAGGTTGTCCATGGTGTGTTCATTTTATTTATGATGAGTATTACATGGCCAATCTCCTTTCGGCACT 3 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-154 6e-36 mmu-mir-496 3e-37 -35.3 (((((.((((.((((((((.(((((..(((((((((........)))))))))..))))).)))))))).))))))))) (-35.30)