mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACAGCAAGTGTAGACAGGCA CCTGTCTGTGCCTGCTGTACA GGTTGTCATTCAGGCTGGGTTGTCATGTGACTGCCTGTCTGTGCCTGCTGTACAGGTGAGCGGATGTTCTGCACAGCAAGTGTAGACAGGCAGACACATGACAACTCTGTCCATCCA 4 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-214 2e-49 rno-mir-214 2e-55 -63.51 ((.((.......(((.(((((((((((((.(((((((((((..(.((((((.((((...........)))).)))))).)..))))))))))).))))))))))))).))))).)). (-63.51)