mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCGACCTCGTGGTCGAGTGG ACTCGACCTGGGGGTCGAGTG ATGAAAACCCTCGACCTCGTGGTCGAGTGGTGAGGTGAAGTTGTGATGTCTTCTACTCGACCTGGGGGTCGAGTGGTCTAT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACGCATAAACACAATAACTATGGTATTTGTAAGTAACTACATGAACATGGAACCATCCATGAAGAACTTGAAGTTTTATTTTCAATAACTATGGTATTTGAGTGATAGGTCGAGTAACAGATAGAAAGTATAACATCGATACTCGACTGCACAGTCTGTTGCCAGGTAGTAACTATGCAGTCGAGTGGTGGTGATGGTGATACTCGACTTCCAGGTACAGTGATGAGGTCGTGTAGTGGTCTGGCAATGAAGGTGAAAACACTCGACCTCGTGGTCGAGTGATGTGATCGAGTGATGGTCAGGTGATGGAAATGAAAACCCTCGACCTCGTGGTCGAGTGGTGAGGTGAAGTTGTGATGTCTTCTACTCGACCTGGGGGTCGAGTGGTCTATTGA 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirnest MIR854 0.0000003 100 -36.3 ......((((((((((((..((((((((((.((.((.........)).))..))))))))))..))))))))).))).... (-36.3)