mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACAAGTTAGGGTCTCAGGGA CCAAGAGCCTGACTTGTGATG CTGCTGGTACCTCTCCGCCTAGGTCCCAAGAGCCTGACTTGTGATGTTACTAAAATACCTCACAAGTTAGGGTCTCAGGGACTAGGAAAAGTCTGGTTTGATGCAG 2 1 3' arm Rattus_norvegicus mirbase lin-4 5e-28 rno-mir-125b-2 8e-45 -46.1 ((((....(((.((...(((((.((((.(((.((((((((((((.((.........)).)))))))))))).)))..)))))))))...))...))).....)))) (-46.10)