mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACACCATTGTCACACTCCA TAGTGTGATGATGGCGTTTG GTAGACGGATAGCCTAGCAGTAGCTGTTTAGTGTGATGATGGCGTTTGATGTTTTGGACACAAACACCATTGTCACACTCCAGAGCTCTGCTAAGGAGAGTCTGTAGGC 5 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-122 3e-35 rno-mir-122 5e-43 -52.5 ((..((((((..((((((((.((((.(..(((((((..((((.(((((.((((...))))))))).))))..)))))))..).))))))))).)))...))))))..)) (-52.50)