mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGTGTTGTCCGTGAATGATT TCCACCACGAACAACTTCTCT GTCCTTAGAGGTAGCATTTGGTACTGAAAAAAGTGTTGTCCGTGAATGATTCGTCACAAGTAAAGCGAATCCACCACGAACAACTTCTCTTCAAGTACCACAGAAAAGCAGAGACA 8 0 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-154 2e-36 oar-mir-382 1e-50 -29.4 (((((........((.((((((((((((......(((((.((((...(((((((..........)))))))...)))).))))).....))).)))))))....)).)))).))). (-29.40)