mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACTATACAACCTACTACCTCA AGCTAGGAGGCTGTACAGTTAT GTTGCTTTGTGCAAGTCCCAAGGAAAGCTAGGAGGCTGTACAGTTATCTCCCTTGTTGTAACTCTAAACTATACAACCTACTACCTCAGCCTGGGAGCATGCCGTCACAGTGGC 6 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase let-7 3e-29 rno-let-7a-2 2e-49 -30.4 ((..((.((.(((.((((((.((..((.(((.(((.((((.((((.....................)))).)))).))).))).))...))))))).).)))...)).))..)) (-30.40)