mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACTATGCAACCTACTACCT GCAGCAGGTCGTATAGTTAA GGCCCTAAGAAAGGCAGCAGGTCGTATAGTTAACTCCTTGTGGGCAAAATCTCTGCCCTAAAACTATGCAACCTACTACCTCTTCCTAGGAGCCC 3 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase let-7 7e-30 rno-let-7d 5e-49 -37.8 (((((((.((((((.((.((((.((((((((.((.....))(((((.......)))))...)))))))).)))).)).))).))).)))).))). (-37.80)